В 2011 году на землю падает НЛО, во время исследования учёные вскрывают запечатанный контейнер, вследствие чего происходит глобальное отравление атмосферы.
Главным героем игры является молодой человек, сын известного путешественника и искателя утраченных технологий Айвена Го. Путешествуя между различными поселениями игрового мира, он пытается выяснить, кто убил его приёмного отца и сжёг родную деревню, постепенно продвигаясь по сюжетной линии он узнаёт многие подробности из жизни своего отца и истории катастрофы. В игре две сюжетные линии, в большинстве отличающихся, но конечная цель одна: узнать причину катастрофы и помочь остаткам человечества.
Ex Machina сочетает черты автосимулятора, аркады и RPG.Действие игры происходит в постапокалиптическом мире, в котором, чтобы выжить, люди вынуждены носить на лицах маски, так как воздух стал непригодным для дыхания. Люди живут в мире, где бронированный грузовик становится единственной надеждой на выживание.